생물공학분야의 이론과 실험을 교육하여, 생물공학의 기술과 응용력 향상을 도모함으로써, 다양한 생물공학분야에서 활약하기 위한 긍지와 사명감을 갖춘 엔지니어를 육성한다.

생물공학은 21세기를 선도하는 중요 학문의 하나로, 본 학과는 생물체 기본 이론과 생물체를 이용한 공학적 실험 및 설계 능력을 습득하고, 이를 활용하여 생물공학 분야의 전반적 문제해결능력을 지닌, 현장 중심의 엔지니어를 육성하는 것을 교육목표로 한다. 이를 위하여 생물공학 이론교육과 이와 연계된 실험실습을 통한 실용화 교육을 위한 학부 실험 프로그램의 지속적 개발과 인력 육성 프로그램을 수행하고 산업체 겸임교수를 활용한 실용 교육의 내실화를 실천한다. 또한 국제화 및 정보화 전문교육을 통해 국제적 감각을 갖출 수 있도록 하고, 미래 지향적인 생물공학 전문교육을 수행하여 창의적 능력을 갖춘 생물공학 전문 인력을 육성함에 있어, 우리사회를 위한 건전한 윤리의식과 문화적 소양을 갖추어 국가발전에 공헌할 수 있는 전문 엔지니어가 되도록 한다.